涵盖436个基因的内分泌遗传疾病NGS虚拟基因组合
CoGenesis® 内分泌疾病是一项全面的次世代测序(NGS)基因组合,涵盖436个基因,跨越14个内分泌疾病类别。它或适合已完成标准检查但仍未获明确诊断的患者。
内分泌系统由调控代谢、生长、生殖及应激反应的腺体和激素网络组成,受复杂的基因调控。内分泌系的功能障碍可引起广泛的临床表现,从细微的儿童生长迟缓,到危及生命的肾上腺危象。这些疾病个别虽属罕见,但整体而言,相当比例的不明原因内分泌功能障碍患者均可找到可识别的遗传原因。
甲状腺疾病: 涵盖甲状腺发育基因(PAX8、NKX2-1、FOXE1)、甲状腺激素合成基因(TPO、TG、DUOX2、SLC5A5)、甲状腺激素转运基因(SLC16A2、SLC26A4)及甲状腺激素受体功能基因(THRA、THRB)。
肾上腺疾病: 类固醇合成基因(CYP11A1、CYP11B1、CYP11B2、CYP17A1、CYP21A2、STAR)用于先天性肾上腺增生症,肾上腺发育基因(NR0B1、MC2R、MRAP、NNT、AAAS)覆盖肾上腺发育不全、糖皮质激素抵抗及Triple-A综合征。
垂体及生长轴: GH1、GHRHR、GHR、IGF1、IGF1R、PAPPA2及垂体转录因子(POU1F1、PROP1、HESX1、LHX3、LHX4),涵盖联合或孤立性垂体激素缺乏症及生长激素不敏感综合征。
性发育障碍(DSD): 性腺决定及类固醇合成基因(SRY、NR5A1、WT1、DMRT1、DHH、MAP3K1),结合雄激素受体及促性腺激素信号基因(AR、FSHR、LHCGR、AMH、AMHR2),覆盖46,XY及46,XX DSD。
单基因糖尿病及高胰岛素血症: MODY基因(HNF1A、HNF1B、HNF4A、GCK、PDX1、NEUROD1)、新生儿糖尿病基因(ABCC8、KCNJ11、INS、EIF2AK3)、先天性高胰岛素血症(GLUD1、HADH)及综合征性糖尿病(WFS1、GLIS3)。
低促性腺激素性性腺功能低下及Kallmann综合征: ANOS1、FGFR1、CHD7、GNRHR、KISS1R、PROK2及逾15个相关基因。
遗传性肥胖及黑色素皮质素通路: LEP、LEPR、MC4R、POMC、PCSK1及相关基因,覆盖严重早发性肥胖症。
脂肪营养不良: AGPAT2、BSCL2、LMNA、CAV1、CAVIN1及相关基因,覆盖先天性及家族性部分脂肪营养不良综合征。
原发性卵巢功能不全(POI): 减数分裂及DNA修复基因(STAG3、MCM8、MCM9、MSH5、HFM1、BMP15、FIGLA、FOXL2)及FMR1。
14 sub-panels included:
| Step / Test | Accuracy | Notes |
|---|---|---|
| Variant calling – SNP | >99.9% | |
| Variant calling – Indel | >99% |
4mL周边血 (EDTA)、2mL唾液或口腔拭子
推荐样本类型:
4毫升血液(EDTA抗凝管)
Codex提供的口腔拭子(4支)
Codex提供的唾液采集套装(2毫升)
**唾液或口腔拭子样本采集:**请遵循包装内的说明;采集前30分钟内请勿进食、饮水或吸烟。
样本必须由持照医疗专业人员采集并提交。
血液样本采集后请保存在 4–8°C;避免冷冻,并在采集后 48 小时内送达。
唾液或口腔拭子样本在室温下可稳定保存长达 7 天。
地址:香港新界白石角香港科技园 16W 座 2 楼 220 室。电话:+852 3008 2560
遗传性内分泌疾病个别虽属罕见,但在儿科及成人内分泌学中整体构成重大诊断挑战。遗传性内分泌疾病的患病率从约1/10,000(CYP21A2突变引起的先天性肾上腺增生症)到1/100,000甚至更低不等。相当比例的不明原因内分泌功能障碍患者在特定基因中携带致病变异,而获得诊断的过程往往是多年的诊断奥德赛,历经生化检测、影像学及逐一的单基因筛查。
内分泌系统在遗传上极为复杂:超过400个不同基因调控激素合成、分泌、转运、受体信号传导及反馈调节。大多数罕见内分泌疾病遵循常染色体显性、常染色体隐性或X连锁遗传规律,通过基因组合测序可识别遗传原因。在先天性甲状腺功能减退症的儿科队列中,15–25%的病例可识别致病变异;联合垂体激素缺乏症中,多基因组合的基因诊断率为20–40%;Kallmann综合征/低促性腺激素性性腺功能低下中,广谱组合测序的诊断率为30–50%。
单基因糖尿病估计占所有糖尿病的1–5%,但严重低估。MODY(主要为HNF1A及GCK亚型)和新生儿糖尿病(ABCC8/KCNJ11)具有直接可操作的遗传结果:磺脲类药物在ABCC8/KCNJ11新生儿糖尿病及HNF1A-MODY中可能有效,通常可消除胰岛素依赖。CYP21A2突变引起的先天性肾上腺增生症(CAH)全球新生儿患病率约1/15,000;基因型影响表型(经典失盐型对比非经典型),分子确诊指导治疗规划及新生儿筛查级联。
性发育障碍(DSD)是遗传上及临床上最为复杂的内分泌疾病类别之一,其分子病因跨越性腺决定、雄激素生物合成、促性腺激素信号传导及性激素受体通路的逾30个基因。分子诊断改变手术规划、激素替代策略、性腺监测要求、生育咨询及受影响个体的性别认同管理。
CoGenesis® 内分泌组合或有助分辨内分泌综合征之间的表型与遗传重叠:相同的临床表现(如原发性闭经、身材矮小、新生儿低血糖)可由数十个不同基因的变异引起。